MRT.exe는 '악성 소프트웨어 제거 도구(Malicious Software Removal Tool)'의 약자로, 마이크로소프트가 제공하는 정품 Windows 프로그램입니다. 이 프로그램은 자체 기능을 수행하는 과정에서 시스템 자원을 소비하기 때문에 실행될 때 CPU와 메모리 사용량이 일시적으로 급증할 수 있습니다.
mrt.exe 프로세스의 높은 CPU 사용량을 유발하는 원인은 몇 가지가 있습니다. 우선 mrt.exe는 Windows에 기본 내장된 제거 도구이기 때문에, 작업 관리자에서 이 프로세스가 실행 중이라고 해서 반드시 바이러스인 것은 아닙니다. 악성 소프트웨어 제거 도구는 매달 Windows 업데이트(매월 두 번째 화요일 '패치 튜즈데이' 업데이트)를 통해 갱신되며, 업데이트 직후 한 번 실행되도록 설계되어 있습니다. 이후에는 다음 업데이트 때까지 다시 실행되지 않습니다. 따라서 mrt.exe가 높은 CPU를 사용하는 모습을 아주 가끔 발견한다면 크게 걱정할 필요가 없습니다. 순간적으로 많은 자원을 소비하는 것은 정상적인 동작입니다.
그러나 mrt.exe가 며칠 동안 계속 실행되고 있다면 위험 신호입니다. 이 도구는 상시 또는 매일 실행되도록 되어 있지 않기 때문에, 작업 관리자에 표시되는 것이 진짜 mrt.exe가 아니라 이를 사칭하는 바이러스일 가능성이 있습니다.
방법 1: Mrt.exe 이름의 파일 삭제
Windows 공식 악성 소프트웨어 제거 도구는 C:\Windows\system32 경로에만 존재해야 합니다. 그 외의 위치에서 발견되는 mrt.exe는 모두 진짜로 위장한 바이러스나 악성코드입니다. 따라서 C:\Windows\system32가 아닌 곳에 있는 mrt.exe 파일을 먼저 삭제해야 합니다.
악성 mrt.exe 파일을 찾아 삭제하는 방법은 다음과 같습니다.
- Windows 키를 누른 상태에서 E 키를 눌러 파일 탐색기를 엽니다.
- Ctrl 키를 누른 상태에서 F 키를 누릅니다(Ctrl + F).
- 검색창에 mrt.exe를 입력하고 Enter 키를 누릅니다.
- Windows가 파일 검색을 마칠 때까지 기다립니다.
- 정상적인 경우 검색 결과에는 mrt.exe가 하나만 표시되어야 합니다. 만약 더 많은 파일이 나타난다면, 해당 파일을 마우스 오른쪽 버튼으로 클릭하고 '파일 위치 열기'를 선택한 뒤, 다시 오른쪽 클릭 → 삭제를 진행합니다. C:\Windows\system32에 있는 파일을 제외한 나머지 mrt.exe 파일 전부에 대해 이 과정을 반복합니다.

- C:\Windows\system32에 있는 파일은 절대 삭제하지 않도록 주의하세요. 검색 결과에서 파일 위치가 함께 표시되므로 이를 통해 구분할 수 있습니다.
- 파일이 삭제되지 않는다면 Ctrl + Shift + Esc 키를 동시에 눌러 작업 관리자를 엽니다. 목록에서 mrt.exe 작업을 찾아 선택한 후 작업 끝내기를 클릭합니다. 그런 다음 위의 단계를 다시 반복하여 파일 삭제를 시도합니다.
여기까지 완료하면 mrt.exe로 인한 높은 CPU 사용량 문제는 더 이상 발생하지 않을 것입니다. 다만 시스템이 확실히 보호되도록 방법 2의 단계도 함께 수행하는 것을 권장합니다.
참고: mrt.exe를 삭제한 후 로그인할 때마다 "MRT를 찾을 수 없습니다"라는 메시지가 나타난다면 아래 단계를 따르세요.
- Microsoft Sysinternals Autoruns 페이지에 접속하여 Autoruns를 다운로드합니다.
- 다운로드가 완료되면 zip 파일의 압축을 풀고(WinRAR 등의 프로그램 필요) Autoruns를 실행합니다.
- Logon(로그온) 탭을 클릭하고 목록에서 mrt.exe를 찾습니다. 해당 탭에서 찾을 수 없다면 Everything(모든 항목) 탭을 클릭하여 mrt.exe를 찾아보세요.

- 목록에서 mrt.exe를 오른쪽 클릭한 후 Delete(삭제)를 선택하고, 추가로 표시되는 확인 창을 승인합니다.
이제 부팅 시 mrt.exe 관련 메시지는 더 이상 나타나지 않을 것입니다.
방법 2: 컴퓨터 바이러스 검사
mrt.exe가 계속 실행되고 있는 것을 확인했다면 컴퓨터가 감염되었을 가능성이 높습니다. 방법 1의 단계를 이미 수행했더라도, 신뢰할 수 있는 백신 프로그램으로 시스템 전체를 검사하는 것이 좋습니다.
- 원하는 백신 프로그램을 다운로드하여 사용하면 됩니다. 어떤 프로그램을 선택해야 할지 모르겠다면 Malwarebytes를 권장합니다. Malwarebytes 공식 웹사이트에서 Windows용 프로그램을 내려받으세요.
- 설치가 완료되면 Malwarebytes를 실행하고 시스템 전체 검사를 진행합니다.
검사와 치료가 완료되면 시스템은 악성코드로부터 자유로워질 것입니다.